食用菌工厂化必需建设洁净室，需要建成洁净室的有：实验室、预冷室、冷却室、接种室。食用菌生产的洁净室除了符合洁净室基本的规范，还要将食用菌生产的理念和生产流程融入到设计中，美克威尔建议在设计食用菌洁净室的时候，一定要有食用菌技术人员参与。建议在食用菌工厂净化装修要注意以下几点：
一、洁净室洁净度等级
食用菌工厂的净化级别需要达到万级标准，高效过滤器出风口需要达到百级。
这个净化标准是普通净化室，食用菌工厂的洁净室，一般物流、人流都较大，而且每天都要有人流和物流。根据菇行天下的经验，万级洁净室在静态状态下，是能够达到万级标准的，当生产的时候，如出锅、冷却、接种的时候尘埃粒子数量迅速增加，无法保证净化级别。
因此，食用菌工厂净化室净化级别提高到千级，而且要增加循环风量和循环次数，以保证在生产时动态的净化级别。
二、洁净室加装紫外线杀菌灯和臭氧发生器
食用菌净化室一般不使用药物进行消毒，所以在设计净化室的时候，要安装紫外线灯管或臭氧发生器，用来消毒空间。
食用菌工厂
三、洁净室地面做耐磨处理
预冷室、冷却室、接种室的地面一定要考虑能否承受周转车车轮的碾压，地面一旦损坏很难修补。普通环氧自流平根本无法承受这种频繁的高强度的碾压，建议做新型耐磨地面，造价高一些，但是坚固耐用。
四、设计10-15%的新风量
在食用菌洁净室循环风中保持10-15%的新风量，能够保证净化室空气清新，环境空气处于动态流动状态，环境指标更稳定。
五、初效过滤器和中效过滤器要便于更换
初效过滤器和中效过滤器一般采用可以清洗材料制作，设计时要考虑方便清洗时拆卸和安装。
六、加大风淋室风量
一般净化公司按照国家标准设计的风淋室风量都偏小，接种室人员流动带入的尘埃数量较多，所以建议加大风淋室的风量。
七、预冷室、冷却室和接种室三个净化室是互通的，要和净化公司说清楚具体工作流程，避免三个净化室压差互相影响。
项目地址：食用菌工厂无菌净化车间工程
项目规模：3000㎡
洁 净 度：百级、万级
项目地址：福建
食用菌无菌洁净车间围护结构
1．彩钢板采用灰白色调，隔墙采用75mm厚聚胺脂彩钢板，吊顶采用75mm厚聚胺脂彩钢板；
2．彩钢板墙与墙、墙与地、墙与顶之间采用R50铝合金圆弧过渡，以减少灰尘积聚和便于清洁。
3．门采用彩钢板加封净化专用双密封门框包封，满足洁净室密闭性要求，或采用烤漆钢制洁净门，密闭、高强，表面光洁，不起尘，易擦洗。
食用菌无菌净化车间空调通风
1．系统型式和气流组织
FAU系统为：新风经过新风冷却室表冷预处理，由FAU送风至各个房间，在由余压阀排出；其中母种和接种间，送风至夹层，在经过FFU过滤；送至房间；
2．房间压差控制洁净区相对一般区及室外保持＞15Pa的正压，
3．制冷、风管系统设计空调采用冷水机组制冷。通风管道送风、回风、新风、排风、除尘管道采用镀锌钢板制作，厚度符合《建筑电气工程施工及验收规范》（GB50303-2002）。设计主风管风速不宜大于10m/s，主支管风速宜为3m/s -6m/s，支管风速不宜大于4m/s。
4．消毒：臭氧发生器消毒。
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